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Um sich vor einer Infektion mit Borreliose zu schützen, gibt es mehrere Möglichkeiten. Allerdings muss man sagen, dass es derzeit keinen hundertprozentigen Schutz vor einem Zeckenstich gibt.
Wichtig ist das das mechanische Absuchen des Körpers nach Zecken, die Verwendung von Abwehrsprays als vorbeugende Maßnahme sowie auf das Tragen von Kleidung, welche alle Körperstellen bedeckt.
Bei der Kleidung sollte darauf geachtet werden, dass es Zecken nicht möglich ist in und unter die Kleidungsstücke zu wandern. ist man oft auf wald und wiesen unterwegs, sollte man sich geeignete wanderkleidung zulegen, die man im Handel schon sehr peisgünstig beziehen kann, ohne sein kostenloses Girokonto übermäßig zu belasten. Zusätzlich sollte die Haut vorher mit im Handel erhältlichen Abwehrsprays und Lotionen behandelt werden.
In den Monaten, wo Zecken besonders aktiv sind, sollte man es vermeiden, leicht bekleidet durch hohes Gras, Büsche und Sträucher zu laufen. Dabei ist besonders darauf zu achten, dass Zecken sich bei heißem und trockenem Wetter zurückziehen. Besonders wohl fühlen sich Zecken in leicht feuchtem Gras und Gesträuch.

In Europa gibt es derzeit keine Möglichkeit einer aktiven oder passiven Immunisierung. Für einen kurzen Zeitraum gab es in den USA einen zugelassenen wirksamen Impfstoff, welcher jedoch aus kommerziellen Gründen vom Markt wieder entfernt wurde.
Bei Hunden wird jedoch eine Impfung gegen die Borreliose auslösenden Bakterien durchgeführt. Bei Experten ist die Wirksamkeit dieser Immunisierung jedoch stark umstritten.

Es wird aber auch an einem wirksamen Impfstoff für Europa geforscht. Allerdings ist dies aufgrund der Vielzahl der Bakterienstämme kompliziert.
Da jedoch in Europa ein für Menschen geeigneter Borreliose-Impfstoff in nächster Zukunft nicht zur Verfügung stehen wird, sind vor allem weitere Forschungen zur Epidemiologie, zum Krankheitsverlauf, der Pathogenese, den diagnostischen Grundlagen und den therapeutischen Interventionen notwendig.